Tàu cao tốc Phú Quý Express sử dụng 02 hệ thống thủy động cơ hiện đại ROLLS ROYCE MTU SERIES 4000. Tàu vận hành trên biển trung bình 29-30 knots, rất ổn định, chịu sóng cao 3-4m.
ROLLS ROYCE MTU SERIES 4000 được ví như là trái tim của tàu Phú Quý Express. Việc sở hữu một động cơ thủy chất lượng cao mtu không những giúp tàu biển hoạt động ổn định trong các điều kiện khó khăn của nước biển mà còn giúp tiết kiệm nhiên liệu và giảm tối đa lượng khí thải ra môi trường.